Den ensomme gymnasieelev, Yukiteru Amano, tilbringer sine dage med at skrive dagbog på sin mobiltelefon, mens han samtaler med sine to tilsyneladende imaginære venner Deus Ex Machina, som er guden for tid og rum, og Murmur, gudens tjener. Da Deus afslører sig selv som en virkelig entitet, giver han Yukiteru en "Random Diary", som viser meget beskrivende indlæg baseret på fremtiden, og tvinger ham ind i et blodigt battle royale med 11 andre indehavere af lignende kraftfulde fremtidsdagbøger.