Den tredje del af et post-apokalyptisk action-skydespil, der udspiller sig midt i en rumvæsen-invasion. De fleste mennesker og dyr er allerede blevet udslettet fra planeten, økosystemet er blevet ændret til at passe til rumvæsnernes behov, og luften er blevet gjort uåndbar for de fleste jordiske skabninger, inklusive mennesker. I Earth Taken 3 starter du som et af de mange mennesker, der er taget til fange af rumvæsnerne. De vil hjernevaske dig og forvandle dig til en tankeløs soldat, der skal kæmpe mod din egen art. Din mission: Flygt og overlev!